酶切位點如何切割dna
㈠ 什麼是限制性內切酶它識別和切割DNA分子有何特點
限制來性內切酶是一種可以源特異性識別特定的DNA位點並對該DNA分子進行切割的一種酶。它識別的位點一般為迴文序列,有這個位點就會切,但不一定是在特異性位點附近切割(可能會將具有這個位點的DNA隨意切割,也可能只在位點附近或位點處切割,要看這種內切酶的類型)。
㈡ DNAman 怎麼分析序列的酶切位點
將待分析的序列裝入Channel,點擊要分析的Channel,然後通過Restriction/Analysis 命令打開對話框.
參數說明如下:
Results 分析結果顯示
其中包括:
Show summary(顯示概要) Show sites on sequence(在結果中顯示酶切位點)
Draw restriction map(顯示限制性酶切圖)Draw restriction pattern(顯示限制性酶切模式圖)
Ignore enzymes with more than(忽略大於某設定值的酶切位點)
Ignore enzymes with less than(忽略小於某設定值的酶切位點)
Target DNA (目標DNA 特性)
circular(環型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)
參數說明如下:
Enzyme
代表(enzyme data file),點擊旁邊的下拉按鈕,出現兩個默認選項,restrict.enz 和dnamane.enz,
如果添加過自製的酶列表,則附加顯示自製酶列表文件名.其中restrict.enz 數據文件包含180 種
限制酶,dnamane.enz 數據文件包含2524 種限制酶.選擇其中一個數據文件,相應的酶在左邊的 顯示框中列出(按酶名稱字母表順序),滑鼠雙擊酶名稱,則對應的酶被選中,在右邊空白框中列 出.要自製酶切列表,可以從左邊酶列表中雙擊滑鼠選擇多種酶(例如puc18 multiple cloning sites),然後點擊按鈕出現下列對話框:輸入要保存酶列表的文件名,點擊按鈕即可保存.自製酶列表可以方便分析特定的酶切位點.
Cutter 酶切識別序列長度;End 酶切產生的末端,其中包括,Blunt(平頭末端),5』Overhang
(5』突出粘性末端),3』Overhang(3』突出粘性末端),系統根據cutter 和end 的設定情況,在左邊酶列表 中顯示符合條件的酶.最後,點擊按鈕執行操作.
㈢ 如何使限制性內切酶切割dna的反應順利進行
內切酶主要分成三大類。
第一類內切酶能識別專一的核苷酸順序,並在識別點附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的雙鏈,但是切割的核苷酸順序沒有專一性,是隨機的。這類限制性內切酶在DNA重組技術或基因工程中沒有多大用處,無法用於分析DNA結構或克隆基因。這類酶如EcoB、EcoK等。
第二類內切酶能識別專一的核苷酸順序,並在該順序內的固定位置上切割雙鏈。由於這類限制性內切酶的識別和切割的核苷酸都是專一的。所以總能得到同樣核苷酸順序的DNA片段,並能構建來自不同基因組的DNA片段,形成雜合DNA分子。因此,這種限制性內切酶是DNA重組技術中最常用的工具酶之一。這種酶識別的專一核苷酸順序最常見的是4個或6個核苷酸,少數也有識別5個核苷酸以及7個、9個、10個和11個核苷酸的。如果識別位置在DNA分子中分布是隨機的,則識別4個核苷酸的限制性內切酶每隔46(4096)個核苷酸就有一個切點。人的單倍體基因組據估計為3×199核苷酸,識別4個核苷酸的限制性內切酶的切點將有(3×109/2.5×102)約107個切點,也就是可被這種酶切成107片段,識別6個核苷酸的限制性內切酶也將有(3×109/4×103)約106個切點。
第二類內切酶的識別順序是一個迴文對稱順序,即有一個中心對稱軸,從這個軸朝二個方向「讀」都完全相同。這種酶的切割可以有兩種方式。一是交錯切割,結果形成兩條單鏈末端,這種末端的核苷酸順序是互補的,可形成氫鍵,所以稱為粘性末端。如EcoRI的識別順序為:
↓ |
5』……GAA | TTC……3』
3』……CTT | AAG……5』
| ↑
垂直虛線表示中心對稱軸,從兩側「讀」核苷酸順序都是GAATTC或CTTAAG,這就是迴文順序(palindrome)。實線剪頭表示在雙鏈上交錯切割的位置,切割後生成5』……G和AATTC……3』、3』……CTTAA和G……5』二個DNA片段,各有一個單鏈末端,二條單鏈是互補的,可通過形成氫鍵而「粘合」。另一種是在同一位置上切割雙鏈,產生平頭末端。例如HaeⅢ的識別位置是:
↓
5』……GG↓CC……3』
3』……CC↓GG……』
↑
在箭頭所指處切割,產生的兩個DNA片段是:
5』……GG CC……3』
和
3』……CC GG……5』
有時候兩種限制性內切酶的識別核苷酸順序和切割位置都相同,差別只在於當識別順序中有甲基化的核苷酸時,一種限制性內切酶可以切割,另一種則不能。例如HpaⅡ和MspⅠ的識別順序都是5』……CCGG……3』,如果其中有5』-甲基胞嘧啶,則只有HpaⅡ能夠切割。這些有相同切點的酶稱為同切酶或異源同工酶(isoschizomer)。
第三類內切酶也有專一的識別順序,但不是對稱的迴文順序。它在識別順序旁邊幾個核苷酸對的固定位置上切割雙鏈。但這幾個核苷酸對則是任意的。因此,這種限制性內切酶切割後產生的一定長度DNA片段,具有各種單鏈末端。這對於克隆基因或克隆DNA片段沒有多大用處。
㈣ 限制性內切酶如何切割,外源DNA怎麼連上去
這一過程需藉助兩種酶:限制性核酸內切酶和DNA連接酶。
限制性核酸內專切酶是可以識別特定的脫屬氧核苷酸序列,並在每條鏈中特定部位的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵進行切割的一類酶,簡稱限制酶。
DNA連接酶利用NAD或ATP中的能量催化兩個核酸鏈之間形成磷酸二酯鍵。反應過程可分三步:
(1)NAD+或ATP將其腺苷醯基轉移到DNA連接酶的一個賴氨酸殘基的ε─氨基上形成共價的酶-腺苷酸中間物,同時釋放出煙醯胺單核苷酸(NMN)或焦磷酸。
(2)將酶-腺苷酸中間物上的腺苷醯基再轉移到DNA的5'-磷酸基端,形成一個焦磷醯衍生物,即DNA-腺苷酸;
(3)這個被激活的5'-磷醯基端可以和DNA的3'-OH端反應合成磷酸二酯鍵,同時釋放出AMP。
㈤ 限制性內切酶能切割DNA單鏈嗎
1. 有少數限制性內切酶能切割DNA單鏈,效率滿低的。
2. 在末端加一些ggcc的和單雙鏈沒有關系,個人覺得和酶與DNA識別binding的結構有關。
㈥ 兩種酶怎麼切割DNA請畫圖,還有目的基因的切割
這是高中生物選修階段的內容,DNA有鏈裝和環裝兩種,兩種酶的切割位點未知,目的回基因也不知道是答處於哪個位置,建議給出具體的題目來更好的解答。
如果要獲取目的基因,那兩種酶不能破壞他,然後用兩種酶可以防止自身環化
㈦ 切割dna片段產物長度怎麼計算
C 分 析: A項中,DNA單鏈中相鄰兩個鹼基之間通過「脫氧核糖—磷酸—脫氧核糖」連接,正確; B項中,Sma I識別的序列為CCCGGG,切割後會產生平末端;圖1所示的DNA分子中含有兩個Sma I的識別位點,第一個識別位點在左端534bp序列向右三個鹼基對的位置;第二個識別位點在右端658bp序列向左三個鹼基對的位置,從這兩個位點切割後產生的DNA片段長度分別為534+3,796-3-3,658+3,即得到的DNA片段長度分別為537bp、790bp和661bp,正確。 C項中,能夠獲取目的基因並切開質粒的限制酶有識別序列為GGATCC的BamH I和識別序列為GATC的Mbo I,若使用Mbo I會同時破壞質粒中的抗生素A抗性基因和抗生素B抗性基因,所以要用BamH I來切割目的基因和質粒,切割後保留了完整的抗生素B抗性基因,便於篩選出含有重組質粒的大腸桿菌。錯誤。 D項中,重組質粒含有抗生素抗性基因,因此成功導入目的基因的大腸桿菌可以抗抗生素,因此一般需要用添加相應抗生素的培養基進行篩選。正確。 考點: 基因工程的操作程序 點評: 本題有一定的難度,是一道高考題的變式,考查了學生的識圖能力、審題能力、理解能力。
㈧ 限制性核酸內切酶是怎樣切割DNA的
不可以
限制性核酸內切酶是識別並切割特異的雙鏈dna序列的一種內切核酸酶。它能識別內雙鏈分子的某種特定核苷酸容序列,使每條鏈中特定部位的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵斷開,而且只能切割dna,不能切割rna。另外,根據酶的專一性也能得出答案
㈨ 限制性核酸內切酶如何切割目的基因(高懸賞)
限制性內切酶的作用機制太復雜了
不同的限制性內切酶作用方式都不一樣
根據維基百回科,可以分為答Type1、2、3、4等多種
不過大體來說,限制性內切酶都能夠特異性識別並結合核酸的特殊反向迴文序列(Inverted repeat palindromes ),然後催化斷裂核苷酸鏈
更多細節請參考http://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_enzyme
㈩ 限制性內切酶如何將dna剪切成不同大小的片段
A、A選項中用B酶單獨切割形成0.5kb、1.9kb和5.6kb三種長度的DNA片段,與實驗結果不符,A錯誤;
B、內B選項中容用A酶切割形成4.2kb、3.8kb兩種長度的DNA片段,與實驗結果不符,B錯誤;
C、C選項中三種酶切位點按照圖示切法後形成DNA片段的長度與圖示相同,C正確;
D、D選項中A酶切割形成4.2kb、3.8kb兩種長度的DNA片段,與實驗結果不符,D錯誤;
故選:C.