bp是什么仪器
㈠ 血糖高的人肚子上装仪器怎么用
那是胰岛素泵
胰岛素泵由泵、小注射器和与之相连的输液管组成。小注射器最多可以容纳3毫升的胰岛素,注射器装入泵中后,将相连的输液管前端的引导针用注针器扎入患者的皮下(常规为腹壁),再由电池驱动胰岛素泵的螺旋马达推动小注射器的活塞,将胰岛素输注到体内胰岛素泵的基本用途是模拟胰腺的分泌功能,按照人体需要的剂量将胰岛素持续地推注到使用者的皮下,保持全天血糖稳定,以达到控制糖尿病的目的
胰岛素泵是一个形状、大小如同BP机,通过一条与人体相连的软管向体内持续输注胰岛素的装置。它模拟人体健康胰腺分泌胰岛素的生理模式。俗称"人工胰腺”。内装有一个放短效或速效胰岛素的储药器,外有一个显示屏及一些按钮,用于设置泵的程序,灵敏的驱动马达缓慢地推动胰岛素从储药器经输注导管进入皮下。输注导管长度不一,牢固地将泵与身体连接起来。
(1)模拟生理胰腺分泌功能,更好地控制血糖,改善HbA1c水平
(2)使用短效或速效胰岛素,同一部位小剂量持续输注,克服了常规注射方法。许多人选择腹部作为胰岛素给药部位,这个部位操作简便,且胰岛素吸收稳定,也可选择臀部、大腿外侧以及手臂三角肌等部位。
一个胰岛素泵由充满胰岛素的储液器(类似一个常规的注射器) 、驱动泵运转的一小节电池以及允许使用者准确调节胰岛素输注量的电脑芯片构成,并全部包含在一个寻呼机大小的塑料盒子里。 储液器通过一个叫做“输注管路”的细塑料管输注胰岛素到身体内。输注管路长61cm或107cm,末端有一个钢针或软针,胰岛素就是从这里注入体内。钢针和软针各有优缺点,一般根据具体情况选择。
㈡ 求一台可以分析气体成分的仪器
气体检测仪结构较简单,只包括探头(传感器)及传感器信号转换电路部分。而气体分析仪不仅在内部装有探头(传感器)而且还有一整套气路系统,即将样气引入到仪器内部,并且再引出仪器放空或回收的全套气路系统。
㈢ 有种在腰腹上的BP机大小的仪器,能测量你一天的运动步伐,这个仪器叫什么名字哪里有卖
运动测量仪!!!医药器材可能有,要么去运动器材那问问!!
㈣ BP的机油怎么样
英国来BP相当的不错,绝对超过美孚自和壳牌,04-05年世界500强排名第2,仅次于沃尔玛,石油公司排名第一。嘉实多就是BP集团下属品牌
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㈤ 高通量测序技术ngs用什么仪器
“普通的基因测序”抄应该是指“常规DNA测序”吧,是用Sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。
高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。
不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(Next generation sequencing),454、Solexa(后改为Illumina)和SOLiD等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。
NGS的特点主要有:
1、通量高。一个RUN能产生500Mb-600Gb的数据量。
2、读长相对较短。454(约400-500bp),llumina(100-250bp),SOLiD(75-100)。
3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。
㈥ 什么是BP石蜡油,什么是300#石蜡油
石蜡油物化性质
性状: 1.本品为无色半透明油状白天无(或近乎无)荧光性液体。 2.冷却时无臭无味,加热时有较弱的石油气味。 3.不溶于水和乙醇,溶于挥发性油,混溶于大多数非挥发性油(不包括蓖麻油)。有一定抑菌作用,被病原菌和霉菌利用而繁殖,易乳化,有渗透性、化性和可塑性,肠内不吸收。 无色半透明状液体,无味无臭。相对密度础。0.831~0.863,闪点164~228℃。可溶于乙醚、石油醚、挥发油,可与多数非挥发性油混溶(不包括蓖麻油),不溶于水和乙醇。对光、热、酸稳定,但长时间受热或光照会慢慢氧化。大白鼠经口1.25g/kg未见异常,ADI不作特殊规定(暂定,FAO/WHO,1994)。
石蜡油的用途: 本品为润滑剂、防粘剂、消泡剂、脱膜剂,发酵助剂、保护(涂)层、上釉剂、抛光剂、赋型剂。 白油的分类通常是根据其饱和烃的纯度进行分类,常用的有工业白油,适用于化纤铝材加工,橡胶增塑等用油,不同的类别的白油在用途上也有所不同。工业级白油用途:用于化纤合纤等工业,作纺织时的润滑剂、溶剂和冷却剂,可使纤维与织物柔软光亮。还可作为合成树脂和塑料加工等工业中的湿润剂溶剂及润滑剂等。也适用于纺织机械、精密仪器的润滑以及压缩机密封用油。 化妆品级白油,适用于做化妆品工业原料,制做发乳、发油、唇膏、护肤脂等,也用于食品、农药。食品(医药)级白油适用于食品上光、防粘、消泡、密封、抛光和食品机械,延长酒、醋、水果、蔬菜或罐头的储存期,以及用作润滑性泻药、药膏和药剂的基础油,药片、药丸的脱模剂,手术器械、制药机械的防腐润滑等。
㈦ pcr试验是什么意思
PCR目录
〔PCR原理〕
PCR反应体系与反应条件
〔PCR步骤〕
〔PCR检测〕
〔PCR反应特点〕
[PCR仪器]
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段。可看作生物体外的特殊DNA复制。
DNA聚合酶(DNA polymerase I)最早于1955年发现 ,而较具有实验价值及实用性的Klenow fragment of E. Coli 则是于70年代的初期由Dr. H. Klenow 所发现,但由于此酶不耐高温,高温能使之变性, 因此不符合使用高温变性的聚合酶链式反应。现今所使用的酶(简称 Taq polymerase), 则是于1976年从 温泉中的细菌(Thermus aquaticus)分离出来的。它的特性就在于能耐高温,是一个很理想的 酶,但它被广泛运用则于80年代之后。PCR最初的原始雏形概念是类似基因修复复制,它是于1971年由 Dr. Kjell Kleppe 提出。他发表了第一个单纯且短暂性基因复制(类似PCR前两个周期反应)的实验。而现今所发展出来的PCR则于1983由 Dr. Kary B. Mullis发展出的,Dr. Mullis当年服务于PE公司,因此PE公司在PCR界有着特殊的地位。Dr. Mullis 并于1985年与 Saiki 等人正式表了第一篇相关的论文。此后,PCR的运用一日千里,相关的论文发表质量可以说是令众多其它研究方法难望其项背。随后PCR技术在生物科研和临床应用中得以广泛应用,成为分子生物学研究的最重要技术。Mullis也因此获得了1993年诺贝尔化学奖。
[编辑本段]〔PCR原理〕
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链,在DNA聚合酶与启动子的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,并设计引物做启动子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
但是,DNA聚合酶在高温时会失活,因此,每次循环都得加入新的DNA聚合酶,不仅操作烦琐,而且价格昂贵,制约了PCR技术的应用和发展。
发现耐热DNA聚合同酶--Taq酶对于PCR的应用有里程碑的意义,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活,不需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临床。
PCR技术的基本原理 类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟, 2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
[编辑本段]PCR反应体系与反应条件
标准的PCR反应体系:
10×扩增缓冲液 10ul
4种dNTP混合物 各200umol/L
引物 各10~100pmol
模板DNA 0.1~2ug
Taq DNA聚合酶 2.5u
Mg2+ 1.5mmol/L
加双或三蒸水至 100ul
PCR反应五要素: 参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)
[编辑本段]〔PCR步骤〕
标准的PCR过程分为三步:
1.DNA变性(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下, 氢键断裂,形成单链DNA
2.退火(25℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。
3.延伸(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右最佳的活性)的作用下,以dNTP为原料,从引物的5′端→3′端延伸,合成与模板互补的DNA链。
每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量既增加一倍。如图所示:
现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度。
[编辑本段]〔PCR检测〕
PCR反应扩增出了高的拷贝数,下一步检测就成了关键。荧光素(溴化乙锭,EB)染色凝胶电泳是最最常用的检测手段。电泳法检测特异性是不太高的,因此引物两聚体等非特异性的杂交体很容易引起误判。但因为其简捷易行,成为了主流检测方法。近年来以荧光探针为代表的检测方法,有逐渐取代电泳法的趋势。
[编辑本段]〔PCR反应特点〕
特异性强
PCR反应的特异性决定因素为:
①引物与模板DNA特异正确的结合;
②碱基配对原则;
③Taq DNA聚合酶合成反应的忠实性;
④靶基因的特异性与保守性。
其中引物与模板的正确结合是关键。引物与模板的结合及引物链的延伸是遵循碱基配对原则的。聚合酶合成反应的忠实性及Taq DNA聚合酶耐高温性,使反应中模板与引物的结合(复性)可以在较高的温度下进行,结合的特异性大大增加,被扩增的靶基因片段也就能保持很高的正确度。再通过选择特异性和保守性高的靶基因区,其特异性程度就更高。
灵敏度高
PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10- 12)量级的起始待测模板扩增到微克(ug=-6)水平。能从100万个细胞中检出一个靶细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中最小检出率为3个细菌。
简便、快速
PCR反应用耐高温的Taq DNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4 小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放射性污染、易推广。
对标本的纯度要求低
不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA 粗制品及RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。
〔PCR的循环参数〕
1、预变性(Initial denaturation).
模板DNA完全变性对PCR能否成功至关重要,一般95℃加热3-5分钟。
2、引物退火(Primer annealing)
退火温度一般需要凭实验(经验)决定。
退火温度对PCR的特异性有较大影响。
3、引物延伸
引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。
延伸时间随扩增片段长短而定。
4、循环中的变性步骤
循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性:
变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。
5、循环数
大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。
6、最后延伸
在最后一个循环后,反应在72℃维持5-15分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。
(四)PCR中的污染和假阳性
PCR中污染主要来自
1、样品间交叉污染;
2、先前PCR产物遗留(carry-over)
[编辑本段][PCR仪器]
pcr仪器的发展
pcr温度循环至关重要,pcr扩增仪各参数必须准确。自perkin –elmer cetus公司第一台pcr扩增仪问世以来,现已有几十家不同的厂家在国内外生产和销售pcr扩增仪。在短短的几年间,扩增仪经过几代的发展,不断采用新技术,并且进一步朝方便、实用、高智能化和自动化的方向发展。
为了便于了解和选购适宜的pcr实验设备,现将部分国内外pcr扩增仪列表如下(表22-5);这些仪器主要用变温铝块、变温水浴及变温气流的方式达到热循环的目的,各有其优缺点。国产1109型dna扩增仪则是用恒温浴机械手移位式。更接近于手工操作。ptc-51a/b体积小,智能化与自动化程序高,可以兼做套式pcr,方便实用。以上各种仪器一般都配有微电脑自动控制温度、时间及循环数,可以达到节 省劳动力的目的。在采用这些仪器作pcr试验之前,一般均应实测管内温度变化循环情况,以了解升、降温时管内因热传导造成的温度滞后情况和实际到达的最高、最低温度,用于修正设计的循环参数。温度滞后受到所用eppendorf管材料、壁厚及形状(与铝块孔匹配程度)的影响,这对变温铝块式仪器影响更大些。对于配用制冷机式半导体元件致冷的仪器,在使用低于室温的温度来保冷pcr反应后小管时,应注意冷凝水的问题,勿使流入仪器内浸湿半导体元件而损坏仪器。
国内外生产的几种dna扩增仪
1109型
北京新技术所与军科院联合
机械臂
变温水浴
电子调温
40×0.5ml
16400元/台
90a/b型
中科院遗传所
机械臂
变温水浴
电热
14000元/台
ptc-51a/b型
军事医学科学院
变温气流
电子调兼作套式
30×0.5ml
12000元/台
dna thermal cycler
perkin –elmercetus(美)
变温铝块
压缩机致冷
48×0.5ml
us $ 20000.-
thermocycler
#60
#00
#180
b..braun
biotech
(德)
变温水浴98℃四档
电热,自来水冷却
60×1.5ml
100×1.5ml
180×1.5ml
dm 30000.-
automatic temperature cy-cler single block twin block
ericomp inc.(美)
变温铝块25~100℃
电热,自来水冷却
29×1.5ml
58×1.5ml
us $4985.-
us $7980.-
grant autogen
grant instrumant ltd(美)
变温水浴0~99℃
电热,自来水冷却或加冷循环器
50×1.5ml
or
50×1.5ml
us $250. –plus
us $ 15.-for
rack(x2)
techne phc-1
phc-2
techne ltd.(英)
变温铝块0~99℃三档
电热500w水冷100w
54×0.5ml
54×0.5ml
24×1.5ml
£3383. –
£3997. -
biooven
biothrm corp(美)
变温气流
-150℃
115v 11a
200’s of 4×96plate
us $ 2990. -
trio-thermo-block tb-1
biomertra(德) 半导体变温
220v
3×20管
分别控温
dm12900. -
micro cycler e
eppendorf(美) 变温铝块
220v/100v
3×29管
us $ 3500. -
〔PCR常见问题〕
PCR产物的电泳检测时间
一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。
假阴性,不出现扩增条带
PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。
模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处 理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应 固定不宜随意更改。
酶失活:需更换新酶,或新旧两种酶同时使用,以分析是否因酶的活性丧失或不够而 导致假阴性。需注意的是有时忘加Taq酶或溴乙锭。
引物:引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称,是PCR失败或扩增条带不 理想、容易弥散的常见原因。有些批号的引物合成质量有问题,两条引物一条浓度 高,一条浓度低,造成低效率的不对称扩增,对策为:①选定一个好的引物合成单 位。②引物的浓度不仅要看OD值,更要注重引物原液做琼脂糖凝胶电泳,一定要有引物条带出现,而且两引物带的亮度应大体一致,如一条引物有条带,一条引物无条带,此时做PCR有可能失败,应和引物合成单位协商解决。如一条引物亮度高,一条亮度低,在稀释引物时要平衡其浓度。③引物应高浓度小量分装保存,防止多次冻融或长期放冰箱冷藏部分,导致引物变质降解失效。④引物设计不合理,如引物长度不够,引物之间形成二聚体等。
Mg2+浓度:Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大,浓度过高可降低PCR扩增的特 异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带。
反应体积的改变:通常进行PCR扩增采用的体积为20ul、30ul、50ul。或100ul,应用多 大体积进行PCR扩增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如20ul 后,再做大体积时,一定要模索条件,否则容易失败。
物理原因:变性对PCR扩增来说相当重要,如变性温度低,变性时间短,极有可能出现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率。有时还有必要用标准的温度计,检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度,这也是PCR失败的原因之一。
靶序列变异:如靶序列发生突变或缺失,影响引物与模板特异性结合,或因靶序列某 段缺失使引物与模板失去互补序列,其PCR扩增是不会成功的。
假阳性
出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致,有时其条带更整齐,亮度更高。
引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。
靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及样进枪头等均应一次性使用。必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。
出现非特异性扩增带
PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带 与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、 或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数 过多有关。其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶 则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引 物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次 数。适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸)。
出现片状拖带或涂抹带
PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量 差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:减少酶量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓 度。增加模板量,减少循环次数。
克隆PCR产物
1)克隆PCR产物的最优条件是什么?
最佳插入片段:载体比需实验确定。1:1(插入片段:载体)常为最佳比,摩尔数比1:8或8:1也行。应测定比值范围。连接用5ul 2X连接液, 50ng质粒DNA,1Weiss单位的T4连接酶,插入片段共10ul。室温保温1小时,或4℃过夜。在这2种温度下,缺T-凸出端的载体会自连,产生蓝斑。室温保温1小时能满足大多数克隆要求,为提高连接效率,需4℃过夜。
2)PCR产物是否需要用凝胶纯化?
如凝胶分析扩增产物只有一条带,不需要用凝胶纯化。如可见其他杂带,可能是积累了大量引物的二聚体。少量的引物二聚体的摩尔数也很高,这会产生高比例的带有引物二聚体的克隆,而非目的插入片段。为此需在克隆前做凝胶纯化。
3)如果没有回收到目的片段,还需要作什么对照实验?
A)涂布未转化的感受态细胞。
如有菌落,表明氨苄失效,或污染上带有氨苄抗型的质粒,或产生氨苄抗型的菌落。
B)转化完整质粒,计算菌落生长数,测定转化效率。
例如,将1ug/ul质粒1:100稀释,1ul用于100ul感受态细胞转化。用SOC稀释到1000ul后,用100ul铺板。培养过夜,产生1000个菌落。转化率为: 产生菌落的总数/铺板DNA的总量。
铺板DNA的总量是转化反应所用的量除以稀释倍数。具体而言转化用10ng DNA,用SOC稀释到1000u后含10 ng DNA,用1/10铺板,共用1 ng DNA。转化率为:
1000克隆X10(3次方) ng /铺板1 ng DNA ug=10(6次方)cfu/ ug
转化pGEM-T应用10(8次方)cfu/ ug感受态细胞
如没有菌落或少有菌落,感受态细胞的转化率太低。
C)如用pGEM-T正对照,或PCR产物,产生>20-40蓝斑(用指定步骤10(8次方)cfu/ ug感受态细胞),表明载体失去T。可能是连接酶污染了核酸酶。T4 DNA连接酶(M1801,M1804,M1794)质量标准好无核酸酶污染,不应用其它来源的T4 DNA连接酶替换。
D)用pGEM-T或pGEM-T Easy载体,连接pGEM-T正对照,转化高频率感受态细胞(10(8次方)cfu/ug),按照指定的实验步骤,可得100个菌落,其中60%应为白斑,如产生>20-40蓝斑, 没有菌落或少有菌落,连接有问题。
4)对照实验结果好,却没有回收到目的片段,实验出了什么问题?
A)连接用室温保温1小时,能满足大多数克隆,为提高效率,需4℃过夜。
B)插入片段带有污染,使3`-T缺失,或抑制连接,抑制转化。为此,将插入片段和pGEM-T正对照混合,再连接。如降低了对照的菌落数,插入片段需纯化,或重新制备。如产生大量的蓝斑,插入片段污染有核酸酶,使pGEM-T或pGEM-T Easy载体3`-T缺失。
C)插入片段不适于连接。用凝胶纯化的插入片段,因受UV过度照射,时有发生。UV过度照射会产生嘧啶二聚体,不利于连接,DNA必需重新纯化。
D)带有修复功能的耐热DNA聚合酶的扩增产物末端无A,后者是pGEM-T或pGEM-T Easy载体克隆所需。加Taq DNA聚合酶和核苷酸可在末端加A。详情查pGEM-T pGEM-T Easy载体技术资料(TM042)。
E)高度重复序列可能会不稳定,在扩增中产生缺失和重排,如发现插入片段高频率地产生缺失和重排,需用重组缺陷大肠杆菌菌株,如SURE细胞
PCR反应体系与反应条件
标准的PCR反应体系:
10×扩增缓冲液 10ul
4种dNTP混合物 各200umol/L
引物 各10~100pmol
模板DNA 0.1~2ug
Taq DNA聚合酶 2.5u
Mg2+ 1.5mmol/L
加双或三蒸水至 100ul
PCR反应五要素: 参加PCR反应的物质主要有五种即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物: 引物是PCR特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。
设计引物应遵循以下原则:
①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。
②引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。
③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。
⑤引物3'端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。
⑥引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。
⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量: 每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。
酶及其浓度 目前有两种Taq DNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反应约需酶量2.5U(指总反应体积为100ul时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。
dNTP的质量与浓度 dNTP的质量与浓度和PCR扩增效率有密切关系,dNTP粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。dNTP溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以1M NaOH或1M Tris。HCL的缓冲液将其PH调节到7.0~7.5,小量分装, -20℃冰冻保存。多次冻融会使dNTP降解。在PCR反应中,dNTP应为50~200umol/L,尤其是注意4种dNTP的浓度要相等( 等摩尔配制),如其中任何一种浓度不同于其它几种时(偏高或偏低),就会引起错配。浓度过低又会降低PCR产物的产量。dNTP能与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度降低。
模板(靶基因)核酸 模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一,传统的DNA纯化方法通常采用SDS和蛋白酶K来消化处理标本。SDS的主要功能是: 溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,SDS 还能与蛋白质结合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,再用有机溶剂酚与氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于PCR扩增。RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。
Mg2+浓度 Mg2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR反应中,各种dNTP浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为1.5~2.0mmol/L为宜。Mg2+浓度过高,反应特异性降低,出现非特异扩增,浓度过低会降低Taq DNA聚合酶的活性,使反应产物减少。
PCR反应条件的选择
PCR反应条件为温度、时间和循环次数。
温度与时间的设置: 基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40 ~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法, 除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性)。
①变性温度与时间:变性温度低,解链不完全是导致PCR失败的最主要原因。一般情况下,93℃~94℃min足以使模板DNA变性,若低于93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物完全变性,就会导致PCR失败。
②退火(复性)温度与时间:退火温度是影响PCR特异性的较重要因素。变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。对于20个核苷酸,G+C含量约50%的引物,55℃为选择最适退火温度的起点较为理想。引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:
Tm值(解链温度)=4(G+C)+2(A+T)
复性温度=Tm值-(5~10℃)
在Tm值允许范围内, 选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合, 提高PCR反应的特异性。复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模板之间完全结合。
③延伸温度与时间:Taq DNA聚合酶的生物学活性:
70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子
70℃ 60核苷酸/S/酶分子
55℃ 24核苷酸/S/酶分子
高于90℃时, DNA合成几乎不能进行。
PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。PCR延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min是足够 的。3~4kb的靶序列需3~4min;扩增10Kb需延伸至15min。延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出现。对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些。
㈧ 心电监护仪都表示什么
心电监护仪来是医院实用的源精密医学仪器,能同时监护病人的动态实用的精密医学仪器。
它可以表示的参数有:心电图形、呼吸、体温、血压(分无创和有创)、血氧饱和度、脉率等生理参数。
心电护测仪是结合心电监测技术与移动计算技术,对心电异常变化进行实时动态监测预警的辅助性诊断设备。该设备具有心电信息的采集、存储、智能分析预警等功能。并具备精准监测、触屏操控、简单便捷等特点。
㈨ bp 是什么刊物的缩写bio——
BIOSIS Previews (BP)
BP简介(1)——收录情况
BP的特点:
1. 提供综合全面的生命科学信息资源,包括:
Biological Abstracts (BA,世界上最权威的生物学信息检索工具之一)
Biological Abstracts/RRM (BA/RRM, Reports, Reviews, and Meetings,专门用于检索报告,综述和会议信息)
BioResearch Index
BP简介(2)——收录情况
来自90多个国家出版的 5,000 多种生物学和生命科学的期刊,及相关的国际会议,综述,书籍和专利信息(主要是美国专利).
其中约2100 生物学和生命科学的出版物为完全收录的,另外3000 种出版物只收录其中有关生命科学的内容.
BP简介(3)——收录情况
内容每周更新,更新条目达一万多条.
可回溯至1969年,包含1300多万条记录.
目前我馆可回溯至1996年.
覆盖所有生命科学的领域,包括:生物化学,生物工程学,遗传学,生物学,植物学,动物学,临床和实验医学,药理学,营养学,农学和兽医学.
BP简介(4)——文献来源
BP简介(5)——检索途径
2. 检索方便快捷,功能强大,提供多个检索入口:
主题(Topic,基于自然语言)
学科(Major Concepts,主要概念)——BP特有
生物分类(Super Taxa)——BP特有
著者(Author)
专利权人(Patent Assignee)
专利号(Patent Number)
来源出版物(Source Publication)
会议信息(Meeting Info)
地址(Address)
BP简介(6)——检索平台
3.基于ISI Web of Knowledge平台
友好的Web检索界面
与ISI(美国科学情报研究所)的其他多种出版物建立动态链接,实现跨学科,跨数据库的交叉检索.
目前BP可以与ISI Web of Science (SCI),ISI Proceedings (ISI的会议录)实现跨库的交叉检索.
ISI属于Thomson Corporation集团,总部在美国费城(ISI的网址:http://www.isinet.com)
Thomson Corporation集团是全球商业和专业市场中提供信息资源及信息服务解决方案最领先的公司之一.
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只能在中山大学的IP范围内使用
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BIOSIS Previews主页
BP的全记录格式及主要字段
BP的主要字段(1)
Title, Author, Address, Abstract, Journal or Book Title (刊名或书名), Source Information (来源信息,如年,卷,期,页码), Document Type (文献类型), Language, Publisher, ISSN/ISBN 等常用字段.
BIOSIS Accession Number(数据库的文献流水号)
Book Editor(图书编者)
Meeting Information(会议信息):
例如:30th Annual Meeting of the American Society of Nephrology
San Antonio, Texas, USA
November 2-5, 1997
American Society of Nephrology
BP的主要字段(2)
Major Concepts* (学科):一般为较大范围的学科分类,如Infection; Parasitology; Pharmacology等
Super Taxa* (上位生物分类):生物分类名(包括微生物),一般为较高级别的生物分类名称.例如:
Muridae: Rodentia, Mammalia, Vertebrata, Chordata, Animalia [鼠科:啮牙目,哺乳动物,脊索动物亚门,脊索动物门,动物]; Serpentes: Reptilia, Vertebrata, Chordata, Animalia [蛇类:爬虫纲,脊索动物亚门,脊索动物门,动物]
Taxa Notes * (分类说明):文献中出现的生物体(包括微生物)的常用名称(一般是上位词). 例如: Nonhuman Vertebrates; Reptiles; Rodents; Vertebrates
BP的主要字段(3)
Organisms * (生物体):一般为生物体的正式学名及常用名,较高一级的学科分类,细胞株等. 例如: Agkistrodon acutus (Serpentes) [尖吻蝮蛇(蛇类)]; rat (Muridae): animal model [鼠(鼠科):动物模型]
Parts, Structures & Systems of Organisms* (生物体的局部,结构和系统):一般从大分子水平揭示上述生物体的组成.例如:liver: digestive system; lung: respiratory system; carotid artery: circulatory system
Diseases* (疾病):人,动物,植物的疾病名称的描述.例如: thrombosis: vascular disease
BP的主要字段(4)
Chemicals & Biochemicals * (化学物质和生化物质):对文献中涉及的化学物质和生化物质的说明.例如:Agkistrodon acutus venom (尖吻蝮蛇蛇毒); F-II-a: fibrinolytic enzyme, thrombolysis effect, venom constituent (F-II-a: 纤维蛋白溶解酶,血栓溶解作用,蛇毒组分);
CAS Registry Numbers(CAS化合物登记号) :文献中涉及的化学物质的登记号(美国化学文摘社给化学物质的唯一号码). 例如:9001-90-5: PLASMIN
Sequence Data* (序列数据):文献中涉及的分子序列数据在基因库(GenBank)的编号.例如:B2123: amino acid sequence; B7632: amino acid sequence;
BP的主要字段(5)
Methods & Equipment (方法和仪器):例如:Western blot: detection method, detection/labeling techniques
Miscellaneous Descriptors (其他描述符):BIOSIS给文献标引的其他主题词(关键词). 例如: hemorrhage; thrombolysis
Alternate Indexing (替代索引):文献中涉及的其他索引词,如MeSH主题词.例如:Thrombosis (MeSH)
其他字段:如 Time, Instry, Persons, Institutions & Organizations*, Geopolical Location*等
注意:上述带*的字段为受控词汇,BP网站提供与这些字段有关的受控词表
BP的检索规则(1)
检索词不分大小写
可直接输入单词或短语,但不能包含标点符号
"-"默认为空格,如输入"IL 2"可检出IL-2及IL 2,输入"IL-2"也可检出IL-2及IL 2,但均不能检出IL2
支持截词"*"," "及布尔逻辑运算符AND,OR,NOT
支持邻近算符SAME
BP的检索规则(2)——截词
= 一个字符 * = 零或多个字符
右侧截断
词间截断 (通配符)
Diseas*
Disease
Diseases
Diseased
_
Lap*roscop*
Laparoscopic
Laproscopic
Laparos
Gene*
Gene
Genes
General
Generation
_
Sul*uri ation
Sulfurization
Sulfurisation
Sulphurization
Sulphurisation
Pharmac*
Pharmacy Pharmacology
Pharmaceutics
Pharmaceutical
Neuros s
Neurosis
Neuroses
BP的检索规则(3)——布尔逻辑运算符
布尔运算符
_
_
TOPIC: biosurfactant* AND food instry
找到的文献必须包括 biosurfactant* and food instry.
_
_
_
当有词的变体或同义词时使用_
TOPIC: lycopersicon esculentum OR tomato
找到的文献至少包含一个检索词.
_
_
_
TOPIC: lactobacillus NOT acidoph*
找到的文献包含, 但不包含acidoph*.
_
BP的检索规则(4)——邻近算符SAME
默认状态下,输入两个检索词,系统作为词组进行检索.
用SAME运算符,要求两个检索词必须出现在同一个句子里,但在句子中的顺序是任意的.
在Topic检索中:
apopto* same gene*
在Address检索中:
aventis same bridgewater
可检索到的记录为:
Address: Aventis Pharmaceuticals, Inc, Route 202-206, Bridgewater, NJ, 08807, USA.
BP的检索规则(5) ——邻近算符SAME
使用邻近算符SAME能在扩大检索范围的同时,提高查准率.
除了Title和Abstract这两个字段外,邻近算符SAME所要求的"两个检索词出现在同一个句子(Sentence)"在下列字段检索时则要求"两个检索词是一个分号(;)里的内容".
包括:Organisms,Major Concepts, Super Taxa, Taxa Notes,Parts, Structures, & Systems of Organisms, Diseases, Chemicals & Biochemicals, Registry Numbers, Sequence Data, Methods & Equipment, Alternate Indexing, Miscellaneous Descriptors 等
上述示例中,其中一个生物体是"human".对这个词的修饰词是Tanzanian, Child, Patient.如果要检索有关Tanzanian儿童疟疾治疗方面的文献,可以用SAME写出检索式为:
Topic: Plasmodium falciparum and (child* same tanzania*)
"Sentences" 在这些项目中是指分号间的内容
修饰词列在主词的后面,修饰词间用逗号分隔.
BP的检索规则(6)
运算符的优先顺序为
( )>SAME>NOT>AND>OR
当使用多个运算符时可用括号决定优先顺序.在一个检索提问中最多可使用50个运算符.
BP的检索步骤
进入检索主菜单,选择检索年份;
选择检索入口(可多个检索途径组合);
输入检索表达式(检索词及其逻辑组配关系);
(BP不提供二次检索,也不提供如同Medline的检索过程列表或多次进行逻辑组配检索,因此检索BP要求先制订检索策略,一次性输入检索式)
进行语种,文献类型或生物体的限定,设定检索结果的排序方式;
如果检索策略比较复杂,可选择保存检索策略;
点击Search进行检索;
浏览并标记检索结果(Summary及Full Record);
检索结果的打印,存盘或 E-mail发送.
主菜单及年份选择
主菜单及年份选择
BP的检索途径——TOPIC检索(1)
TOPIC检索(主题检索)是最常用的检索途径.
BP采用relational indexing(相关索引)技术,提供基于自然语言的索引机制.
点击Title Only则限定检索词只出现在标题.
TOPIC检索时,输入检索式后,系统将自动对多个字段同时进行检索.
BP的检索途径——TOPIC检索(2)
检索示例:蛇毒纤维蛋白溶解酶的克隆表达及分离纯化
检索策略:采用TOPIC检索,检索表达式为: TOPIC=venom* AND (fibrinolytic enzyme* OR thrombolytic therapy) AND (purificat* OR clon*)
注意:要求在检索框中一次性输入检索表达式,可用各种运算符号
BP的检索途径——TOPIC检索(3)
BP的检索途径——MAJOR CONCEPTS检索
应用Major Concepts检索时,一般可输入学科名称进行相关领域的大范围检索.
Major Concepts为受控字段检索,点击List可浏览Major Concepts的内容(包括按字顺排列及按学科排列两种方式),复制粘贴感兴趣的Major Concepts并进行检索.
在TOPIC检索时已经自动进行Major Concepts检索.
Major Concepts检索与TOPIC检索可组合使用,以提高查准率.
例如:检索蛇毒的毒理学方面的研究内容,可用Topic检索与Major Concepts检索进行组合.
检索蛇毒药理学方面的研究内容(组合检索)
BP的检索途径——SUPER TAXA检索
应用Super Taxa检索时,一般输入生物分类名称进行检索.
注意应尽量使用较高级别的分类名称,以扩大检索范围,保证查全率.
Super Taxa为受控字段检索,点击List可浏览点击Super Taxa 名称.
在TOPIC检索时已经自动进行Super Taxa检索.
Super Taxa也可与TOPIC检索可组合使用,以提高查准率.
组合检索示例:腺病毒与肿瘤的基因疗法
组合检索示例:宫颈癌与单纯疱疹病毒感染
BP的检索途径——AUTHOR检索
著者检索时可输入多位作者的名字(100个).
检索时姓用全称,名字可用缩写或全称.
为防漏检,可采用姓用全称,名字首字母后加"*"进行检索,同时结合其他检索途径提高查准率.
注意:BP的记录中,著者字段一般姓与名之间用"," 再加空格分隔,且姓及首名字用全称.
中国人的姓名表达方式经常出错,检索时应小心.
示例:Smith Alison M 可检出 Smith, Alison M.
Smith Alison 可检出Smith, Alison.
Smith Alison* 可检出Smith, Alison
Smith, Alison D.
Smith, Alison M, 等等.
著者检索示例:检索颜光美(Yan Guangmei)教授的论文被BP收录情况
作者检索结果
BP的检索途径——PATENT ASSIGNEE及PATENT NUMBER检索
PATENT ASSIGNEE检索:输入专利权人的名称(可以是个人,也可以是机构)进行检索.
如果专利权人是机构,应注意机构的不同表达方式
PATENT NUMBER检索:输入专利号进行检索.
注意:BP仅收录了1995-1999年的美国专利
示例:检索诺华公司的专利
专利检索结果——概要(Summary)
专利检索结果——全记录格式(Full Record)
专利检索结果——全记录格式(Full Record)
BP的其他检索途径(1)
(1)SOURCE PUBLICATION(来源出版物检索)
主要用于检索某一刊物或图书是否被BP收录
检索时必须正确输入刊名的全称,如果输入刊名缩写,一般应使用截词,以防漏检.
点击List可浏览BP收录的所有来源出版物,了解某一刊物是否被BP所收录,帮助正确选择刊名.
检索书名时一般与TOPIC检索组合,或使用SAME邻近算符
点击List可浏览按字顺排列的BP的来源出版物的全称
示例:检索Anticancer Research被BP收录的文献
来源出版物检索结果
BP的其他检索途径(2)
(2)MEETING INFO(会议信息检索)
可输入会议名称,会议主办地点,会议主办者和会议日期等信息,并用AND或SAME连接.
如果要检索某一篇特定的会议论文,可采用组合检索,如TOPIC检索与MEETING INFO检索组合,AUTHOR检索与MEETING INFO检索组合,以提高查准率.
示例:查找1997年召开的美国第30届肾脏病学年会的会议文献(30th Annual Meeting of the American Society of Nephrology, San Antonio, Texas, USA,
November 2-5, 1997, American Society of Nephrology
检索信息检索结果
会议论文信息
示例:查找1997年召开的美国第30届肾脏病学年会上有关肾移植的文献
BP的其他检索途径(3)
(3) ADDRESS(作者地址检索)
可直接输入作者地址
作者地址常采用截词方式
可使用邻近算符SAME,以提高查准率
示例:检索中山医科大学发表的论文被BP收录情况
检索结果
检索结果的限定及排序方式选择
点击Set limits and sort options,可对检索结果及排序方式进行限定.
检索结果的限定包括
语种 (Language)
文献类型 (Document Types)
生物体 (Organisms)
检索结果的浏览和标记(1)
检索结果的两种浏览方式为Summary(概要)和Full record(全记录)
Summary包含了文献的题录信息,包括作者,篇名,来源.
在Summary浏览文献时,标记记录(Marked List)的方式有两种:
(1)点击记录左边的标记盒,然后点击Submit按钮
(2)选择Mark All标记所有记录(最多500条)
点击Submit后,页面上方出现Marked List标记,点击可浏览选中的信息
检索结果的浏览和标记(2)
Full record给出了每一条记录的全部信息
如果购买了Web of Science,则可以在Full record页面与Cited reference, Citing reference及Related records建立动态链接
标记记录列表
检索结果的输出
检索结果的输出方式包括:
打印记录:可选择要打印的字段
保存记录:将选中的记录保存
将记录输出到文献信息管理软件
电子邮件传递
订购全文
检索策略保存
如果检索策略比较复杂,可将检索策略保存到磁盘中,以便今后检索时使用
保存检索策略
运行已保存的检索策略
BP的帮助系统
BP总结
BP与Medline,PubMed的对比
BP作业
1,查找有关人的肺癌基因芯片的英文文献.
(基因芯片:microarray OR gene chip)
2,查找2002年发表的有关妊娠巨细胞病毒感染文献.
(巨细胞病毒cytomegalovirus,属于Herpesviridae病毒科)
3,查找2002年9月在匈牙利布达佩斯召开的欧洲糖尿病研究协会第38届年会有关糖尿病性高血压的会议文献.
( 38th Annual Meeting of the European Association for the Study of Diabetes (EASD)
Budapest, Hungary
September 01-05, 2002
European Association for the Study of Diabetes)
以上作业,要求写出检索策略,每题摘录1条检索结果的题录(包括篇名,作者,出处)